PrimeMate für Google Chrome

PrimeMate: Schneller und optimierter Primer-Generator für Ensembl

PrimeMate ist ein Chrome-Add-On, das von PrimeMate entwickelt wurde und als Primer-Generator für Ensembl dient. Es ermöglicht Benutzern, Hunderte von Primer-Paaren mit anpassbaren Parametern zu generieren und sie nach ihren Vorlieben zu sortieren.

Mit PrimeMate können Benutzer einfach mit der Ensembl-Genomdatenbank arbeiten, indem sie einfach zur gewünschten Sequenz navigieren und auf "Primers suchen" klicken. Das Add-On bietet eine Reihe von anpassbaren Optionen wie optimale Produktlänge, Schmelztemperatur, G/C-Gehalt und Dimerisierungs-/Hairpin-Schwelle.

Eine der herausragenden Funktionen von PrimeMate ist die Möglichkeit, detaillierte Informationen für jedes Produkt anzuzeigen, einschließlich Länge, Schmelztemperatur und Exon-Position. Benutzer können auch die generierten Ergebnisse basierend auf ihren bevorzugten Kriterien sortieren, indem sie das Sortierungsgewicht für jede Variable anpassen.

PrimeMate geht einen Schritt weiter, indem es automatisch unerwünschte Produkte filtert, wie zum Beispiel selbst-dimerisierende Primer oder solche mit suboptimalen Positionen auf der Sequenz. Es bietet auch die Möglichkeit, vom Benutzer ausgewählte Sequenzen in einer "Favoriten"-Zeile zum einfachen Zugriff zu speichern und ermöglicht nahtloses Teilen durch Kopieren der Sequenzen in die Zwischenablage.

Insgesamt ist PrimeMate ein leistungsstolles und effizientes Werkzeug zur Primer-Generierung in Ensembl, das eine benutzerfreundliche Oberfläche und eine Vielzahl anpassbarer Optionen bietet.